Effectivement, en jouant avec ces paramètres, je suis arrivé au bon résultat
En activant "Enable retraction at bottom and top of models", je me suis débarassé de la cicatrice sur la dernière couche, mais pas celle du plateau intermédiaire (ce n'est pas une des dernières couches).
Pour que les deux soient clean, il m'a fallu désactiver "Avoid retraction inside models".
Merci