Hello @pommeverte merci pour ta réponse si rapide.
Je ne sais pas si c'est la fait de poster ma question, mais dans la foulée j'ai trouvé la solution qui est bêtissime.
Je n'avait pas vu que mes configuration de steps/mm n'était pas prises en compte, le fait d'être repassé à 200/200/1600 sur la config DEFAULT_AXIS_STEPS_PER_UNIT
La seule condition était de faire un RESET EEPROM depuis mon écran m'a permis de prendre les valeurs du firmware.
Encore merci.